維護圓柱亞克力魚缸的生態系統，先要搞清楚你的魚缸缺少哪些關鍵元素，放置的元素比例是否合適。元素缺失越少，各元素比例越接近自然條件，需要的養護工作越少；相反，這需要更多的努力。這里有兩個具體的例子來說明。
除了上述浮游生物外，還缺乏能夠吸收廢物產生氧氣的腐生底棲生物和高級水生植物；此外，為了獲得更飽滿的觀賞感，魚的密度往往達到過濾器的上限，也就是細菌與魚的比例接近失衡。看來除了浮游生物，所有的主要元素都存在于水族箱里，比如帶有生化過濾器的“大型觀賞魚缸”，底層的沙子，大量的水生植物，吃藻類的蝦，還有少量的魚，除了飼養，沒有別的辦法了嗎？的確，這個水生態的大型水族館的維護相對較少，但據說并不完整。事實上，水體中各種元素的比例嚴重失衡，魚類太少，代謝廢物太少，而水生植物和細菌相對過多，整個水體呈現“負營養”狀態，有利于抑制藻類生長，促進魚類健康，但對水生植物和細菌不利，營養不良會削弱水生植物和細菌，如果不加以控制，整個水體系統將崩潰，雜草死亡，來之不易的水生美將失去。因此，我們加肥料，我們加二氧化碳，我們加硝化細菌，由于缺乏草食動物(我們引進大型觀賞水族館來避免)，水生植物的生長失控，需要定期修剪，去除枯葉和腐爛的葉子，削減太長的莖，調整生長密度。
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